You are viewing an old version of this page. View the current version.

Compare with Current View Page History

« Previous Version 8 Next »

We are currently varying two parameters of the system in order to find where the system operates best i.e. has the biggest difference in output between the +aBeta and -aBeta. The parameters are the amount of Receptor-TCS-Gal4VP16 construct transfected (since we have seen that a large amount of transfection places a strain on the cell) and how much TEVp-Cofilin is expressed. 

Tuning

LilrB2

Trial 1 Transfection

Well 1

 

 

Well 2

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:LilrB2 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Dummy 200ng

Well 3

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:LilrB2 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Well 4

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-G4VP16 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Dummy 200ng

Well 5

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-G4VP16 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Dummy 200ng

500 nM aBeta

Well 6
Well 7

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

1 nM Dox

Well 8

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

1 nM Dox

500 nM aBeta

Well 9

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

2000 nM Dox

 

Well 10

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

200 nM Dox

500 nM aBeta

Well 11

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

1 nM Dox

Well 12

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

1 nM Dox

500 nM aBeta

Well 13

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

10 nM Dox

Well 14

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

10 nM Dox

500 nM aBeta

Well 15

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

1000 nM Dox

 

Well 16

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

1000 nM Dox

500 nM aBeta

Well 17

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

2000 nM Dox

Well 18

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

2000 nM Dox

500 nM aBeta

Well 19

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

10 nM Dox

 

Well 20

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

10 nM Dox

500 nM aBeta

Well 21

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

1000 nM Dox

 

Well 22

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

1000 nM Dox

500 nM aBeta

Well 23

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 25 ng

Dummy 175ng

100 nM Dox

Well 24

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:LilrB2-TCS-Gal4VP16 25 ng

Dummy 175ng

100 nM Dox

500 nM aBeta

PirB

Trial 1 Transfection Plan 

Trial 1 Transfection

Well 1

 

 

Well 2

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Dummy 200ng

Well 3

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Well 4

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB-TCS-G4VP16 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Dummy 200ng

Well 5

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB-TCS-G4VP16 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Dummy 200ng

500 nM aBeta

Well 6
Well 7

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

1 nM Dox

Well 8

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

1 nM Dox

500 nM aBeta

Well 9

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

2000 nM Dox

 

Well 10

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

200 nM Dox

500 nM aBeta

Well 11

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

1 nM Dox

Well 12

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

1 nM Dox

500 nM aBeta

Well 13

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

10 nM Dox

Well 14

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

10 nM Dox

500 nM aBeta

Well 15

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

1000 nM Dox

 

Well 16

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

1000 nM Dox

500 nM aBeta

Well 17

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

2000 nM Dox

Well 18

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

2000 nM Dox

500 nM aBeta

Well 19

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

10 nM Dox

 

Well 20

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

10 nM Dox

500 nM aBeta

Well 21

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

1000 nM Dox

 

Well 22

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

1000 nM Dox

500 nM aBeta

Well 23

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 25 ng

Dummy 175ng

100 nM Dox

Well 24

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 25 ng

Dummy 175ng

100 nM Dox

500 nM aBeta

RESULTS

Controls
Well 1

 

 

Well 2

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Dummy 200ng

Well 3

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Well 4

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB-TCS-G4VP16 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Dummy 200ng

Well 5

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:PirB-TCS-G4VP16 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

Dummy 200ng

500 nM aBeta

100 ng PirB
Well 7

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

1 nM Dox

Well 8

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

1 nM Dox

500 nM aBeta

Well 9

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

2000 nM Dox

 

Well 10

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 100ng

Dummy 100 ng

200 nM Dox

500 nM aBeta

50 ng PirB
Well 13

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

10 nM Dox

Well 14

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

10 nM Dox

500 nM aBeta

Well 15

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

1000 nM Dox

 

Well 16

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 50ng

Dummy 150 ng

1000 nM Dox

500 nM aBeta

25 ng PirB
Well 23

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 25 ng

Dummy 175ng

100 nM Dox

Well 24

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 25 ng

Dummy 175ng

100 nM Dox

500 nM aBeta

  
12.5 ng PirB
Well 19

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

10 nM Dox

 

Well 20

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

10 nM Dox

500 nM aBeta

Well 21

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

1000 nM Dox

 

Well 22

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 12.5 ng

Dummy 187.5 ng

1000 nM Dox

500 nM aBeta

    
    
6.25 ng PirB
Well 11

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

1 nM Dox

Well 12

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

1 nM Dox

500 nM aBeta

Well 17

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

2000 nM Dox

Well 18

hEF1a:tagBFP 200ng

hEF1a:rtTA 200ng

TRE:TEVp-Cofilin 200ng

Gal4UAS:mKate 200ng

hEF1a:PirB-TCS-Gal4VP16 6.25 ng

Dummy 193.75 ng

2000 nM Dox

500 nM aBeta

  • No labels